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科普講堂|實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法

更新時(shí)間:2023-01-03瀏覽:1835次

   聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)是一種用于放大擴(kuò)增特定的DNA片段的分子生物學(xué)技術(shù)結構重塑,它可看作是生物體外的特殊DNA復(fù)制,PCR的最大特點(diǎn)是能將微量的DNA大幅增加示範推廣。目前知識和技能,PCR成為分子生物學(xué)研究的一部分。實(shí)時(shí)熒光定量PCR(Quantitative Real-time PCR)技術(shù)約定管轄,是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán)數據,利用熒光信號(hào)積累實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)整個(gè)PCR進(jìn)程,最后通過(guò)標(biāo)準(zhǔn)曲線對(duì)模板進(jìn)行定量分析的方法發揮。該項(xiàng)技術(shù)可以對(duì)DNA顯著、RNA樣品進(jìn)行相對(duì)定量、絕對(duì)定量和定性分析開放以來,提高了普通PCR技術(shù)的特異性和準(zhǔn)確性占,被廣泛應(yīng)用于基礎(chǔ)研究、疾病診斷提供了有力支撐、農(nóng)業(yè)檢測(cè)和法醫(yī)調(diào)查等領(lǐng)域供給。

  一、常規(guī)PCR
  利用DNA分子會(huì)在體外95°高溫時(shí)會(huì)發(fā)生變性解旋變成單鏈實事求是,然后降溫到60°C左右時(shí)引物會(huì)與單鏈DNA按堿基互補(bǔ)配對(duì)原則結(jié)合進行探討,接著再升高溫度到72°C左右,即DNA聚合酶最適反應(yīng)溫度服務水平,DNA聚合酶會(huì)沿著磷酸到五碳糖(5'-3')的方向合成相應(yīng)的互補(bǔ)鏈最新,如此循環(huán)往復(fù)以達(dá)到DNA分子擴(kuò)增的目的,常規(guī)PCR技術(shù)無(wú)法實(shí)現(xiàn)精確定量處理方法。
  二重要作用、實(shí)時(shí)熒光定量PCR
  如要對(duì)DNA、RNA樣品進(jìn)行精確定量研究習慣,就需要采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR充足,根據(jù)檢測(cè)實(shí)時(shí)熒光PCR產(chǎn)物的方式不同,實(shí)時(shí)熒光定量PCR主要有DNA結(jié)合染料法導向作用、基于探針的化學(xué)法方案、淬滅染料引物法等類型。
  1.DNA結(jié)合染料法
  原理:應(yīng)用一種帶有熒光的十大行動、非特異的DNA結(jié)合染料檢測(cè)PCR過(guò)程中積累的擴(kuò)增產(chǎn)物左右。
  應(yīng)用于核算定量和基因表達(dá)驗(yàn)證。
  優(yōu)缺點(diǎn):它們的優(yōu)點(diǎn)是可以對(duì)任何雙鏈DNA進(jìn)行定量綜合措施,不需要探針可靠保障,具有相對(duì)高的靈敏度和可靠性,并且成本低,簡(jiǎn)單易用開展,缺點(diǎn)是它們能在反應(yīng)中結(jié)合所有的DNA雙鏈互動互補,其中包括在PCR過(guò)程中產(chǎn)生的引物二聚體或其他非特異產(chǎn)物。
  染料法一般使用的是SYBR Green I染料意向,這是一種可以與雙鏈DNA小溝結(jié)合的熒光染料意料之外,不會(huì)與單鏈DNA結(jié)合,并且在游離狀態(tài)下幾乎無(wú)熒光形式,只有與雙鏈DNA結(jié)合才會(huì)發(fā)出熒光置之不顧,因此將PCR擴(kuò)增產(chǎn)生的雙鏈DNA數(shù)量與熒光強(qiáng)度直接關(guān)聯(lián),產(chǎn)生實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)的效果數字化。
  2.基于探針的化學(xué)法
  原理:應(yīng)用一個(gè)或多個(gè)熒光標(biāo)記的寡核苷酸探針檢測(cè)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物方便;依賴熒光能量共振傳遞檢測(cè)特異性擴(kuò)增產(chǎn)物。
  應(yīng)用于核酸定量深刻內涵、基因表達(dá)驗(yàn)證傳遞、等位基因鑒別、SNP分型深入闡釋、病原體和病毒檢測(cè)相關性、多重PCR。
  優(yōu)缺點(diǎn):探針?lè)ǖ蔫b別能力遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于DNA結(jié)合染料法提高,因?yàn)樗鼈冎慌c目的產(chǎn)物結(jié)合可以使用,從不與引物二聚體或其他非特異產(chǎn)物結(jié)合進入當下,缺點(diǎn)是它的合成價(jià)格高紮實。
  探針?lè)ㄖ谐S玫腡aqMan探針是一種寡核苷酸探針,熒光基團(tuán)連接在探針的5’末端新體系,而淬滅基團(tuán)則在3’末端投入力度,PCR擴(kuò)增時(shí)在加入引物的同時(shí)加入探針,探針完整時(shí)不難發現,熒光信號(hào)被淬滅基團(tuán)吸收貢獻法治,PCR擴(kuò)增時(shí),5’→3’外切酶活性將探針酶切降解發展需要,使熒光基團(tuán)和淬滅基團(tuán)分離攻堅克難,從而檢測(cè)器可以接收到熒光信號(hào)。
  3.淬滅染料引物法
  原理:采用熒光標(biāo)記引物擴(kuò)增顯示,從而使熒光標(biāo)記基團(tuán)直接摻入PCR擴(kuò)增產(chǎn)物中雙向互動,依賴熒光能量共振傳遞。
  應(yīng)用于核酸定量設計能力、基因表達(dá)驗(yàn)證品牌、等位基因鑒別、SNP分型、病原體和病毒檢測(cè)等形式、多重PCR
  優(yōu)缺點(diǎn):探針和目標(biāo)片段的特異性結(jié)合產(chǎn)生熒光信號(hào)技術的開發,因此減少了背景熒光和假陽(yáng)性,還可進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增飛躍,缺點(diǎn)是原料成本價(jià)格高
  三更高效、實(shí)時(shí)熒光PCR儀
  實(shí)時(shí)熒光PCR系統(tǒng)包括熱循環(huán)儀,用于熒光激發(fā)的光學(xué)系統(tǒng)以及用于收集熒光數(shù)據(jù)和管理分析的計(jì)算機(jī)軟件重要部署,數(shù)據(jù)通過(guò)實(shí)時(shí)分析軟件以圖表的形式顯示影響。

 

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